다염기변이 유전체와 메타유전체 조립 및 일배체형 추출

Subject

Host

과학기술부(과학재단)

Program

바이오기술개발사업

Summary

염기변이가 적은 유전체의 서열을 결정하기 위한 기존의 방법은 염기변이가 많은 유전체의 서열을 결정하는 데에는 한계가 있다. 다염기변이 유전체에 최적화된 염기서열 결정을 위한 방법을 개발하는 것이 연구의 목표이다. 다염기변이 유전체들에 새로운 방법을 적용하고, 결과를 기존의 유전체서열과 비교 분석한다. 또한 유전자들의 서열과 위치를 새롭게 예측하여, 기존에 예측된 유전자들의 수, 서열, 위치를 비교한다. 특정 환경에서 생존하는 많은 미생물들로 구성된 유전체집합은 염기변이로 인해 서열조립의 복잡성이 증가한다. 본 연구를 통해 미생물들의 유전체집합에 특화된 서열결정 방법을 개발한다. 기존의 데이타에 새로운 방법을 적용해 얻은 결과와 기존의 결과를 비교 분석한다. 새롭게 개발된 방법론들을 적용하여 얻어진 다염기변이 유전체와 메타유전체의 염기서열, 유전자서열, 유전자발현 정보들을 데이터베이스에 저장하고 웹 인터페이스를 개발한다.